36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1708 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1708  protein of unknown function DUF264  100 
 
 		 421 aa  825    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.644471  normal  0.0322658 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1430  protein of unknown function DUF264  91.45 
 
 		 421 aa  716    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.396368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1434  hypothetical protein  96.67 
 
 		 458 aa  751    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4961  hypothetical protein  74.29 
 
 		 432 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000421894 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3147  hypothetical protein  65.31 
 
 		 416 aa  508  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.284595  normal  0.0189351 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1160  hypothetical protein  63.36 
 
 		 422 aa  505  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1408  hypothetical protein  62.41 
 
 		 422 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3490  hypothetical protein  62.74 
 
 		 423 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1800  hypothetical protein  61.83 
 
 		 423 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.983484  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1964  hypothetical protein  64.42 
 
 		 386 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.817651 
 
 
-
 
NC_004310  BR0585  terminase large subunit, putative  62.6 
 
 		 384 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3472  hypothetical protein  63.54 
 
 		 431 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2102  protein of unknown function DUF264  64.43 
 
 		 386 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000296249  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0586  putative terminase large subunit  61.82 
 
 		 380 aa  462  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1330  large terminase  55.45 
 
 		 459 aa  429  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1976  hypothetical protein  61.83 
 
 		 370 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.493623  normal  0.545091 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3704  hypothetical protein  51.68 
 
 		 446 aa  403  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2178  hypothetical protein  54.68 
 
 		 452 aa  398  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0902  hypothetical protein  54.18 
 
 		 448 aa  395  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225304 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1074  hypothetical protein  54.93 
 
 		 414 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541704  normal  0.984253 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2902  hypothetical protein  52.22 
 
 		 463 aa  383  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176162  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1631  hypothetical protein  50.25 
 
 		 483 aa  383  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576046  normal  0.91477 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1057  hypothetical protein  52.71 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0533808 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1129  hypothetical protein  53.94 
 
 		 414 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2467  putative large terminase  53.94 
 
 		 414 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0918  hypothetical protein  52.02 
 
 		 450 aa  363  2e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3118  hypothetical protein  51.34 
 
 		 440 aa  353  2e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3918  hypothetical protein  52.01 
 
 		 439 aa  352  5.9999999999999994e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0145321 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2004  hypothetical protein  48.43 
 
 		 436 aa  329  7e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0120622 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1896  hypothetical protein  45.41 
 
 		 443 aa  176  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3628  hypothetical protein  44.59 
 
 		 690 aa  172  9e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3043  protein of unknown function DUF264  42.21 
 
 		 435 aa  171  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2716  Phage uncharacterized protein-like  45.18 
 
 		 458 aa  160  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0633  hypothetical protein  40.64 
 
 		 509 aa  152  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3483  hypothetical protein  32.84 
 
 		 453 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0384  hypothetical protein  55.26 
 
 		 426 aa  86.3  8e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.22896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>