15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1393 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1393  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  681    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.650924  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1231  hypothetical protein  96.85 
 
 		 349 aa  617  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1172  hypothetical protein  89.37 
 
 		 357 aa  614  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.669426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5106  hypothetical protein  64.66 
 
 		 344 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.126128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0202  hypothetical protein  37.5 
 
 		 382 aa  182  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0145  hypothetical protein  37.5 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.472245 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0286  hypothetical protein  38.46 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3364  hypothetical protein  35.6 
 
 		 339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000469169  normal  0.0159414 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4442  hypothetical protein  32.29 
 
 		 324 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0722  hypothetical protein  35.09 
 
 		 324 aa  116  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19760  predicted glycosyl transferase  34.96 
 
 		 363 aa  105  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3875  hypothetical protein  36.36 
 
 		 325 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.23354 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26660  predicted glycosyl transferase  32.46 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.666341 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1277  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N- acetylglucosamine transferase  33.07 
 
 		 368 aa  47.4  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3197  hypothetical protein  26.06 
 
 		 346 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>