12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_R0026 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_R0026  tRNA-Arg  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0031  tRNA-OTHER  100 
 
 
97 bp  58  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000256784  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0008  tRNA-Arg  87.5 
 
 
72 bp  56  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.605764  normal  0.032651 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0040  tRNA-Gly  96.67 
 
 
72 bp  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0024  tRNA-OTHER  96.55 
 
 
97 bp  50.1  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0033  tRNA-Gly  96.43 
 
 
71 bp  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0021  tRNA-Arg  84.75 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.905442  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0012  tRNA-Lys  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.711012  normal  0.109612 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0010  tRNA-Lys  96.15 
 
 
97 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0011  tRNA-Lys  96.15 
 
 
96 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.935376  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0038  tRNA-Arg  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.91696  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t20  tRNA-Arg  96.15 
 
 
124 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>