7 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_R0012 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_R0012  tRNA-Ser  100 
 
 
86 bp  170  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0051  tRNA-Ser  95.74 
 
 
85 bp  77.8  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00598275  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0032  tRNA-OTHER  94.59 
 
 
104 bp  58  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0066  tRNA-Ser  100 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.332689 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0029  tRNA-Ser  100 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000794935  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0036  tRNA-Ser  100 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.122746 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.510995 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>