23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0592 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0592  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  502  1e-141  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.323051  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0074  hypothetical protein  54.17 
 
 
256 aa  263  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1506  NUDIX hydrolase  34.87 
 
 
390 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4094  hypothetical protein  32.92 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1796  hypothetical protein  38.03 
 
 
252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1833  hypothetical protein  38.03 
 
 
252 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0646  hypothetical protein  31.91 
 
 
249 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1804  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.807933  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1073  hypothetical protein  33.61 
 
 
240 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 
441 aa  105  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7376  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 
246 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  30.8 
 
 
456 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6630  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 
245 aa  92  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.707478  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1524  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 
260 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27390  hypothetical protein  30.41 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0368828  normal  0.805501 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1729  hypothetical protein  26.59 
 
 
253 aa  86.3  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.754048 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5481  hypothetical protein  29.24 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1709  hypothetical protein  27.8 
 
 
227 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0260  hypothetical protein  30.68 
 
 
169 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.764522  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2399  hypothetical protein  27.06 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3523  hypothetical protein  28.96 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1598  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1550  Protein of unknown function DUF2210  26.47 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0426394  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3994  hypothetical protein  43.37 
 
 
86 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>