26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_R0043 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_R0043  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  242  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0040  5S ribosomal RNA  83.81 
 
 		 119 bp  73.8  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.344564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0037  5S ribosomal RNA  83.81 
 
 		 119 bp  73.8  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.234158 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0039  5S ribosomal RNA  91.07 
 
 		 121 bp  71.9  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0024  5S ribosomal RNA  82.86 
 
 		 119 bp  65.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.683593  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0024  5S ribosomal RNA  94.87 
 
 		 123 bp  61.9  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0041  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 122 bp  56  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.541052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0023  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 122 bp  56  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451348  normal  0.87366 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0036  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 122 bp  56  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.380144 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0044  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.834046 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0043  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.834046 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0055  5S ribosomal RNA  86.54 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0021  5S ribosomal RNA  86.54 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.080713 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0423  5S ribosomal RNA  89.74 
 
 		 111 bp  46.1  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0015  5S ribosomal RNA  89.74 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0031  5S ribosomal RNA  89.74 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618538  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0047  5S ribosomal RNA  89.74 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292676  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0050  5S ribosomal RNA  89.74 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000265937  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0056  5S ribosomal RNA  89.74 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0213918  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0034  5S ribosomal RNA  89.74 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0048  5S ribosomal RNA  89.74 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.424673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0021  5S ribosomal RNA  89.74 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0061  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  44.1  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0058  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  44.1  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0051  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  44.1  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0034  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  44.1  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>