80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0423 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0423  5S ribosomal RNA  100 
 
 
111 bp  220  6e-56  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0015  5S ribosomal RNA  86.15 
 
 
117 bp  58  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0833  5S ribosomal RNA  86.67 
 
 
109 bp  56  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0380  5S ribosomal RNA  86.67 
 
 
109 bp  56  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TCrrnaB5S  5S ribosomal RNA  89.83 
 
 
116 bp  54  0.000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TCrrnaA5S  5S ribosomal RNA  89.83 
 
 
151 bp  54  0.000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_r1370  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 
36 bp  54  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_r0656  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 
36 bp  54  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.757563  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa5SD  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 
117 bp  52  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0421933  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0003  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 
116 bp  52  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.73811e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0042  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 
116 bp  52  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.488998  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0022  5S ribosomal RNA  90.48 
 
 
89 bp  52  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0166  5S ribosomal RNA  90.48 
 
 
89 bp  52  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r1705  5S ribosomal RNA  90.48 
 
 
89 bp  52  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r1832  5S ribosomal RNA  90.48 
 
 
89 bp  52  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.172239  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0068  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 
116 bp  52  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG_r05  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 
117 bp  52  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG_r04  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 
117 bp  52  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.866925  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG_r03  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 
117 bp  52  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG_r02  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 
117 bp  52  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0289952  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG_r01  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 
117 bp  52  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.873865  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa5SF  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 
117 bp  52  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflr03  5S ribosomal RNA  91.89 
 
 
103 bp  50.1  0.0001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflr06  5S ribosomal RNA  91.89 
 
 
76 bp  50.1  0.0001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0023  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 
114 bp  48.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0008  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 
114 bp  48.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000537705  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0020  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 
114 bp  48.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0079  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 
119 bp  48.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0007  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 
114 bp  48.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0528996  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0077  5S ribosomal RNA  90 
 
 
121 bp  48.1  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0007  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 
119 bp  48.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0062  5S ribosomal RNA  90 
 
 
121 bp  48.1  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000016841  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0011  5S ribosomal RNA  90 
 
 
120 bp  48.1  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0005  5S ribosomal RNA  90 
 
 
119 bp  48.1  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185376  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0012  5S ribosomal RNA  88.64 
 
 
116 bp  48.1  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0063  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 
114 bp  48.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.455895  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0068  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 
114 bp  48.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0079  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 
114 bp  48.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0063  5S ribosomal RNA  88.64 
 
 
116 bp  48.1  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00852672  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0060  5S ribosomal RNA  88.64 
 
 
116 bp  48.1  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0055  5S ribosomal RNA  88.64 
 
 
116 bp  48.1  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0031  5S ribosomal RNA  88.64 
 
 
116 bp  48.1  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0028  5S ribosomal RNA  88.64 
 
 
116 bp  48.1  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000903183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0017  5S ribosomal RNA  88.64 
 
 
116 bp  48.1  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00334647  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0005  5S ribosomal RNA  88.64 
 
 
116 bp  48.1  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.493215  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0063  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 
114 bp  48.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SA  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 
115 bp  48.1  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SB  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 
115 bp  48.1  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0481886  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SC  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 
115 bp  48.1  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SD  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 
115 bp  48.1  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SE  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 
115 bp  48.1  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SF  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 
115 bp  48.1  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SG  1 ribosomal RNA  91.67 
 
 
115 bp  48.1  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000030846  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r0451  5S ribosomal RNA  90 
 
 
119 bp  48.1  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.135782 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1564  5S ribosomal RNA  90 
 
 
119 bp  48.1  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1583  5S ribosomal RNA  90 
 
 
119 bp  48.1  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1618  5S ribosomal RNA  90 
 
 
119 bp  48.1  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.636533 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1803  5S ribosomal RNA  90 
 
 
119 bp  48.1  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000167597 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1797  5S ribosomal RNA  90 
 
 
119 bp  48.1  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  7.20962e-24 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0068  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 
114 bp  48.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0022  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 
114 bp  48.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0019  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 
119 bp  48.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.296052  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0008  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 
119 bp  48.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808782  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0043  5S ribosomal RNA  89.74 
 
 
122 bp  46.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0010  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 
113 bp  44.1  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0057  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 
116 bp  44.1  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0009  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 
116 bp  44.1  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0008  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 
116 bp  44.1  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0003  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 
116 bp  44.1  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000187832  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r1781  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 
127 bp  44.1  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.386687  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0412  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 
124 bp  44.1  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0961397  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0184  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 
127 bp  44.1  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00848557  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0048  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 
111 bp  44.1  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.130794  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0053  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 
116 bp  44.1  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0034  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 
116 bp  44.1  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0007  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 
116 bp  44.1  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0053  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 
111 bp  44.1  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0282002  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0171  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 
124 bp  44.1  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.114955  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0082  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 
124 bp  44.1  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0022  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 
124 bp  44.1  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0311578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>