34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2168 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2168  diphthamide biosynthesis protein  100 
 
 
317 aa  641    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.614157  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1846  diphthamide biosynthesis protein  64.95 
 
 
315 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2082  diphthamide biosynthesis protein  62.38 
 
 
315 aa  374  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2613  diphthamide biosynthesis protein  58.78 
 
 
295 aa  349  3e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0218  hypothetical protein  53.35 
 
 
316 aa  342  7e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1634  diphthamide synthase subunit  45.17 
 
 
335 aa  264  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1436  diphthamide biosynthesis protein  44.26 
 
 
331 aa  256  3e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1635  diphthamide biosynthesis protein  41.16 
 
 
334 aa  241  2e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1803  diphthamide biosynthesis protein  36.96 
 
 
349 aa  224  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2799  diphthamide biosynthesis protein  39.55 
 
 
349 aa  223  3e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.815597  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2492  diphthamide biosynthesis protein  38.08 
 
 
348 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3588  diphthamide biosynthesis protein  36.96 
 
 
353 aa  221  9.999999999999999e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0813  diphthamide biosynthesis protein  37.15 
 
 
347 aa  218  8.999999999999998e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0484  diphthamide biosynthesis protein  36.88 
 
 
325 aa  202  5e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1270  diphthamide biosynthesis protein  32.38 
 
 
333 aa  169  6e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1864  diphthamide biosynthesis protein  32.7 
 
 
332 aa  153  4e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.866923 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0882  diphthamide biosynthesis protein  36.89 
 
 
340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1563  diphthamide biosynthesis protein  31.53 
 
 
331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0905  diphthamide biosynthesis protein  25.37 
 
 
331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0764  diphthamide biosynthesis protein  27.84 
 
 
309 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43090  predicted protein  31.35 
 
 
452 aa  116  5e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0109024  normal  0.0260674 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1187  diphthamide biosynthesis protein  26.43 
 
 
309 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.20081  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1488  diphthamide biosynthesis protein  27.03 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1190  diphthamide biosynthesis protein  24.77 
 
 
309 aa  110  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20589  predicted protein  30.46 
 
 
434 aa  91.7  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35812  predicted protein  26.13 
 
 
421 aa  89.4  7e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0979008 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1360  hypothetical protein  29.45 
 
 
303 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00886743 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1114  diphthamide biosynthesis protein  27.55 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1734  hypothetical protein  26.8 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00147027 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0393  diphthamide biosynthesis protein  25.51 
 
 
303 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0784701 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1133  diphthamide biosynthesis protein  27.05 
 
 
337 aa  63.2  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.45882 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07400  cytoplasm protein, putative  26.02 
 
 
529 aa  52.8  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.185161  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06283  Diphthamide biosynthesis protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AZJ7]  27.81 
 
 
193 aa  52.8  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.558592  normal  0.316973 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32667  predicted protein  24.16 
 
 
517 aa  50.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.563535  normal  0.65168 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>