88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2128 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2128  MoaD family protein  100 
 
 
92 aa  185  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1335  MoaD family protein  44.57 
 
 
92 aa  91.3  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383136  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1315  thiamineS protein  51.11 
 
 
93 aa  91.3  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.538156  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0009  MoaD family protein  36.96 
 
 
92 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.555142  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0478  hypothetical protein  37.78 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0189  hypothetical protein  36.56 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356126  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0524  thiamineS  35.11 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.422466 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0338  MoaD family protein  30.43 
 
 
92 aa  60.5  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000126888  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2207  thiamineS  30.43 
 
 
92 aa  58.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0854681  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1542  MoaD family protein  34.41 
 
 
95 aa  56.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0947  MoaD family protein  29.47 
 
 
93 aa  52  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.092475 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0908  moaD family protein  26.32 
 
 
93 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1564  MoaD family protein  35.11 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0932  molybdopterin synthase small subunit  35.56 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0286  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.16 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4556  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.17 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.896791 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0287  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.16 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0279  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.16 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0391  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.07 
 
 
83 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2859  molybdopterin synthase small subunit  35.56 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  hitchhiker  0.00418424 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0838  molybdopterin synthase small subunit  35.56 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2858  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.56 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0807  molybdopterin synthase small subunit  35.56 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0028903  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2568  molybdopterin synthase small subunit  35.56 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0481357  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0283  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.07 
 
 
83 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00768  hypothetical protein  35.56 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2523  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.22 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0699  MoaD family protein  33.33 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0478  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.87 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3527  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  32.97 
 
 
83 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00751  molybdopterin synthase, small subunit  35.56 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1293  molybdopterin converting factor, subunit 1  35 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202321  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4432  molybdopterin converting factor, subunit 1  35 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24650  MoaD family protein  31.46 
 
 
90 aa  47.8  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0954  molybdopterin synthase small subunit  35.56 
 
 
81 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0840  molybdopterin synthase small subunit  35.56 
 
 
81 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0868  molybdopterin synthase small subunit  35.56 
 
 
81 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0855763  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0899  molybdopterin synthase small subunit  35.56 
 
 
81 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2168  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.63 
 
 
83 aa  47.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.84 
 
 
364 aa  47  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1068  molybdopterin converting factor, subunit 1:MoaD_  32.98 
 
 
81 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.679928  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0084  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.44 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2668  MoaD family protein  31.46 
 
 
111 aa  46.2  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.390258  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2369  hypothetical protein  33.7 
 
 
92 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1248  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  33.68 
 
 
81 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4117  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.07 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1996  MoaD family protein  29.67 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.416193  normal  0.106112 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0931  molybdopterin synthase small subunit  34.44 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3746  molybdopterin synthase subunit MoaD  36.26 
 
 
83 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0847  molybdopterin synthase small subunit  34.44 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.277735  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0276  molybdopterin synthase subunit MoaD  36.26 
 
 
83 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000186467 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0275  molybdopterin synthase subunit MoaD  36.26 
 
 
83 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000298217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0900  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.79 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0472678  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1338  MoaD family protein  27.96 
 
 
100 aa  45.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.973248 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0384  MoaD family protein  28.72 
 
 
91 aa  44.7  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0937  MoaD family protein  35.87 
 
 
92 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771117  normal  0.577382 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0090  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.79 
 
 
83 aa  44.3  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.320274  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3054  molybdopterin converting factor, subunit 1  31.18 
 
 
77 aa  44.3  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2432  molybdopterin converting factor, subunit 1  29.79 
 
 
81 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.554739  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4450  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  34.07 
 
 
83 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7560  thiamineS protein  36.76 
 
 
90 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1515  molybdopterin synthase small subunit  33.33 
 
 
81 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0496  molybdopterin converting factor small subunit  32.29 
 
 
97 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1415  molybdopterin converting factor small subunit MoaD  27.96 
 
 
112 aa  43.5  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00239633  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0174  MoaD family protein  30.43 
 
 
111 aa  43.9  0.0009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.704451  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4399  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.78 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0335567  hitchhiker  0.000558782 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2591  molybdopterin converting factor, subunit 1  30.85 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257626  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4729  MoaD family protein  31.18 
 
 
221 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.554846  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0825  MoaD family protein  29.67 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.145179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0965  molybdopterin synthase subunit MoaD  32.98 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2920  molybdopterin synthase small subunit  27.78 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107943  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0103  molybdopterin converting factor, subunit 1  28.72 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00524284  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2136  molybdopterin synthase subunit MoaE / molybdopterin synthase subunit MoaD  32.29 
 
 
248 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3946  thiamineS protein  30.43 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1436  molybdopterin synthase small subunit  27.78 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0246  MoaD family protein  27.66 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2834  molybdopterin synthase small subunit  27.78 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.794895  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1688  thiamineS protein  34.78 
 
 
90 aa  41.6  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.000869432  hitchhiker  0.00000468877 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0016  MoaD family protein  27.66 
 
 
92 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.767605  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01049  molybdopterin converting factor, small subunit  31.18 
 
 
82 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.286152  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1323  molybdopterin synthase small subunit  28.72 
 
 
81 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.444725  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3295  thiamineS protein  30.43 
 
 
84 aa  41.2  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2949  molybdopterin synthase small subunit  31.11 
 
 
81 aa  41.2  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.446076  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1029  molybdopterin synthase small subunit  34.44 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1276  molybdopterin synthase small subunit  29.79 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.116417  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0475  MoaD family protein  29.79 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2001  MoaD family protein  31.18 
 
 
228 aa  40.8  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1191  molybdopterin converting factor small subunit  31.18 
 
 
83 aa  40.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>