14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2434 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1926  transposase, putative  100 
 
 
137 aa  275  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.155953  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2434  transposase, putative  100 
 
 
137 aa  275  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0131194  normal  0.314095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2555  transposase, putative  98.33 
 
 
354 aa  240  3.9999999999999997e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000867882  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2758  transposase, putative  98.33 
 
 
354 aa  240  5e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.189488  normal  0.0138803 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0799  transposase, putative  98.33 
 
 
354 aa  238  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0038  transposase, putative  97.5 
 
 
354 aa  237  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00111468  normal  0.0316372 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1266  transposase, putative  97.5 
 
 
354 aa  237  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3290  transposase, putative  97.5 
 
 
354 aa  237  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3303  transposase, putative  96.67 
 
 
354 aa  232  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.356059  normal  0.100304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1399  transposase, putative  56.3 
 
 
231 aa  148  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.225081  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0018  hypothetical protein  96.67 
 
 
67 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148317  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1670  transposase, putative  42.19 
 
 
248 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00916168  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3083  transposase, IS4  42.19 
 
 
305 aa  104  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.291285  normal  0.365369 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0017  transposase, putative  97.73 
 
 
278 aa  91.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222637  normal  0.0337825 
 
 
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