15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1892 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1892  putative small heat shock protein  100 
 
 		 99 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.249328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0687  putative small heat shock protein  67.44 
 
 		 86 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.115278 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2323  putative small heat shock protein  50.57 
 
 		 100 aa  98.2  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.814003  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1810  hypothetical protein  51.55 
 
 		 98 aa  94  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0688  putative small heat shock protein  38.04 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.111955 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1840  heat shock protein Hsp20  39.71 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.388818 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1620  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 175 aa  43.9  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0537  heat shock protein Hsp20  34.88 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0220395 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1657  heat shock protein Hsp20  32.56 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.760781 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1810  heat shock protein Hsp20  32.56 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1631  heat shock protein Hsp20  42.47 
 
 		 145 aa  42  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1695  heat shock protein Hsp20  30.86 
 
 		 151 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  30.68 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0640  heat shock protein Hsp20  34.15 
 
 		 170 aa  40  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.402449  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 150 aa  40  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>