35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1634 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1634  diphthamide synthase subunit  100 
 
 
335 aa  679    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1436  diphthamide biosynthesis protein  65.24 
 
 
331 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1846  diphthamide biosynthesis protein  45.86 
 
 
315 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2168  diphthamide biosynthesis protein  45.17 
 
 
317 aa  264  1e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.614157  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1635  diphthamide biosynthesis protein  40.48 
 
 
334 aa  260  2e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2613  diphthamide biosynthesis protein  45.39 
 
 
295 aa  257  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2492  diphthamide biosynthesis protein  39.76 
 
 
348 aa  257  2e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0218  hypothetical protein  42.59 
 
 
316 aa  257  2e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2799  diphthamide biosynthesis protein  40.24 
 
 
349 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.815597  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1803  diphthamide biosynthesis protein  39.4 
 
 
349 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3588  diphthamide biosynthesis protein  39.1 
 
 
353 aa  250  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0813  diphthamide biosynthesis protein  39.17 
 
 
347 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0484  diphthamide biosynthesis protein  37.73 
 
 
325 aa  239  2.9999999999999997e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2082  diphthamide biosynthesis protein  43.17 
 
 
315 aa  239  4e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.829732 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1270  diphthamide biosynthesis protein  31.79 
 
 
333 aa  159  5e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1864  diphthamide biosynthesis protein  32 
 
 
332 aa  154  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.866923 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1563  diphthamide biosynthesis protein  33.56 
 
 
331 aa  151  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0882  diphthamide biosynthesis protein  33.44 
 
 
340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0764  diphthamide biosynthesis protein  29.57 
 
 
309 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1187  diphthamide biosynthesis protein  29.27 
 
 
309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.20081  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1488  diphthamide biosynthesis protein  28.35 
 
 
309 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1190  diphthamide biosynthesis protein  27.63 
 
 
309 aa  126  6e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0905  diphthamide biosynthesis protein  29.08 
 
 
331 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20589  predicted protein  29.75 
 
 
434 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43090  predicted protein  25.54 
 
 
452 aa  97.4  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0109024  normal  0.0260674 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35812  predicted protein  27.39 
 
 
421 aa  90.9  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0979008 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1114  diphthamide biosynthesis protein  28.57 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1360  hypothetical protein  28.8 
 
 
303 aa  87.8  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00886743 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1133  diphthamide biosynthesis protein  26.35 
 
 
337 aa  78.6  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.45882 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0393  diphthamide biosynthesis protein  24.16 
 
 
303 aa  72.4  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0784701 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02230  peptidyl-diphthamide biosynthesis, putative  24.04 
 
 
515 aa  67.4  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1734  hypothetical protein  27.15 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00147027 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05179  Diphthamide biosynthesis protein 2 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B2Q1]  21.17 
 
 
582 aa  60.8  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.585818  normal  0.793927 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07400  cytoplasm protein, putative  26.49 
 
 
529 aa  49.3  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.185161  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32667  predicted protein  24.51 
 
 
517 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.563535  normal  0.65168 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>