20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1607 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1607  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  443  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.536381  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0214  hypothetical protein  50 
 
 
198 aa  186  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0685  protein of unknown function DUF447  38.04 
 
 
187 aa  125  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.217415 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1414  hypothetical protein  39.57 
 
 
185 aa  124  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.378071  normal  0.11817 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0665  hypothetical protein  35.52 
 
 
202 aa  116  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1727  hypothetical protein  38.89 
 
 
191 aa  112  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1107  hypothetical protein  37.97 
 
 
188 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0768  hypothetical protein  37.31 
 
 
193 aa  106  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2337  protein of unknown function DUF447  26.36 
 
 
215 aa  61.2  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0425454  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1323  hypothetical protein  26.44 
 
 
181 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2584  protein of unknown function DUF447  23.96 
 
 
192 aa  53.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.735694  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1353  hypothetical protein  25.58 
 
 
181 aa  52  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0630  hypothetical protein  25.29 
 
 
181 aa  52  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1332  hypothetical protein  28.43 
 
 
187 aa  48.1  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.424525  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0035  protein of unknown function DUF447  24.24 
 
 
222 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0765  protein of unknown function DUF447  24.62 
 
 
198 aa  47  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00979308  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1782  protein of unknown function DUF447  26.38 
 
 
195 aa  45.1  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1890  protein of unknown function DUF447  23.35 
 
 
227 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2617  hypothetical protein  23.68 
 
 
196 aa  43.5  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0409017  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2424  protein of unknown function DUF447  24.75 
 
 
201 aa  42.4  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0904426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>