33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1606 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1606  putative triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  100 
 
 		 347 aa  716    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0213  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  54.55 
 
 		 315 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0767  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  39.94 
 
 		 288 aa  218  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0684  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  38.24 
 
 		 272 aa  197  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.383906 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1415  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  38.29 
 
 		 273 aa  193  3e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.231859  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1728  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  37.62 
 
 		 268 aa  191  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2583  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  38.23 
 
 		 277 aa  172  6.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.153542  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0666  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  35.13 
 
 		 272 aa  170  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.308218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1108  hypothetical protein  35.91 
 
 		 268 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0036  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  35.83 
 
 		 295 aa  147  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1215  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  32.09 
 
 		 293 aa  142  6e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.748005 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1459  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  32.09 
 
 		 293 aa  142  8e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0740  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  31.78 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24203  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1295  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  30.96 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.967286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0764  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  33.13 
 
 		 280 aa  139  8.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0134158  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1228  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  30.86 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1891  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  31.97 
 
 		 283 aa  122  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2336  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  30.43 
 
 		 322 aa  102  7e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0290582  normal  0.194172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1656  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  28.34 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000354952  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5944  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  29.7 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0163114 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3533  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  28.88 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3166  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  23.28 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2435  putative triphosphoribosyl- dephospho-CoA synthetase  26.16 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2611  ATP:dephospho-CoA triphosphoribosyl transferase  26.51 
 
 		 297 aa  50.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.251639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0328  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  23.98 
 
 		 286 aa  50.1  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2865  ATP:dephospho-CoA triphosphoribosyl transferase  25.76 
 
 		 288 aa  50.1  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1192  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  22.98 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0532  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  26.17 
 
 		 279 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0126  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  21.52 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.090418  hitchhiker  0.00094044 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0527  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  25.15 
 
 		 292 aa  43.1  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1757  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  22.99 
 
 		 301 aa  43.1  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3148  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  24.12 
 
 		 298 aa  43.1  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2407  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  24.56 
 
 		 342 aa  43.1  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.457209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>