18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1476 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1476  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  650    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199967  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1477  hypothetical protein  77.78 
 
 
351 aa  525  1e-148  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0253  hypothetical protein  30.48 
 
 
298 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3724  hypothetical protein  27.21 
 
 
424 aa  97.1  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119305  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1126  hypothetical protein  27.48 
 
 
657 aa  80.1  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1125  hypothetical protein  27.1 
 
 
657 aa  79.3  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.837381  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2019  hypothetical protein  26.32 
 
 
498 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.387729  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1487  hypothetical protein  27.84 
 
 
764 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.330928  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1127  hypothetical protein  24.73 
 
 
489 aa  66.2  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.582071  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1699  hypothetical protein  26.5 
 
 
489 aa  63.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.72795 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1105  hypothetical protein  26.12 
 
 
537 aa  63.2  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1124  hypothetical protein  26.64 
 
 
868 aa  60.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2198  hypothetical protein  24.4 
 
 
747 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0450097  normal  0.656514 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2640  hypothetical protein  22.63 
 
 
497 aa  52.8  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.310714  normal  0.0812139 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1107  hypothetical protein  23.89 
 
 
695 aa  52.8  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1529  hypothetical protein  40.85 
 
 
290 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.352197  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1308  APHP domain-containing protein  31.36 
 
 
1085 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0025589  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2873  hypothetical protein  24.49 
 
 
493 aa  42.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238418  normal  0.779586 
 
 
-
 
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