17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1080 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1080  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  240  5e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1140  hypothetical protein  61.74 
 
 		 115 aa  154  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3390  transcriptional regulator, TrmB  24.32 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0320  transcriptional regulator, TrmB  22.43 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3986  transcriptional regulator, TrmB  25.23 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.958939  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0014  transcriptional regulator, TrmB  29.52 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.682046  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0728  transcriptional regulator, TrmB  27.97 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.22819  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0154  transcriptional regulator, TrmB  29.52 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.487715  normal  0.0526976 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0781  transcriptional regulator, TrmB  26.26 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.44791 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0714  transcriptional regulator, TrmB  29.52 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1748  transcriptional regulator, TrmB  29.52 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2144  transcriptional regulator, TrmB  24.77 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3632  transcriptional regulator, TrmB  23.42 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4295  transcriptional regulator, TrmB  23.42 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2097  transcriptional regulator TrmB  27.27 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0817  transcriptional regulator, TrmB  24.04 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2705  transcriptional regulator, TrmB  25.81 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>