20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0461 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0461  prefoldin subunit alpha  100 
 
 
144 aa  291  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.735379  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0111  prefoldin subunit alpha  45.45 
 
 
138 aa  126  8.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.162217  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1565  prefoldin subunit alpha  33.33 
 
 
153 aa  67  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0430  prefoldin, alpha subunit  32.23 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0238  prefoldin, alpha subunit  33.33 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0395  prefoldin subunit alpha  28.89 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0549936 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1477  hypothetical protein  27.56 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000022612  hitchhiker  0.000493368 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0871  prefoldin, alpha subunit  24.8 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0822  prefoldin, alpha subunit  37.74 
 
 
152 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.777251  normal  0.974063 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1329  prefoldin, alpha subunit  35.44 
 
 
155 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0780  prefoldin subunit alpha  26.67 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.428943  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0108  prefoldin subunit alpha  28.91 
 
 
144 aa  48.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0756158  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1816  prefoldin, alpha subunit  32.61 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1230  prefoldin, alpha subunit  31 
 
 
152 aa  47  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.720721 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1203  prefoldin subunit alpha  26.56 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.14629  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0715  prefoldin subunit alpha  24.6 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.347569 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1966  prefoldin, alpha subunit  25.56 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1630  prefoldin subunit alpha  27.42 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000524897  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3021  prefoldin alpha subunit  26.77 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1321  prefoldin, alpha subunit  27.83 
 
 
147 aa  40  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.189768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>