41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0396 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0396  endonuclease III  100 
 
 		 174 aa  358  3e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0042  hypothetical protein  51.47 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.899596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0414  protein of unknown function DUF123  48.57 
 
 		 144 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.434904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0198  hypothetical protein  49.25 
 
 		 144 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000406548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2461  hypothetical protein  44.7 
 
 		 148 aa  134  7.000000000000001e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0051  hypothetical protein  52.14 
 
 		 151 aa  131  5e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3196  protein of unknown function DUF123  44.07 
 
 		 141 aa  99  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0507  hypothetical protein  42.37 
 
 		 139 aa  94.7  6e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0319472  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0898  protein of unknown function DUF123  36.64 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0253075  normal  0.780245 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02280  hypothetical protein  39.29 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273401  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1462  protein of unknown function DUF123  35.54 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0654  protein of unknown function DUF123  35.78 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2695  hypothetical protein  37.23 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.34 
 
 		 356 aa  74.3  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0278  protein of unknown function DUF123  38.39 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0991873  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.5 
 
 		 356 aa  72.4  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  38.66 
 
 		 356 aa  71.2  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0625  hypothetical protein  35.29 
 
 		 119 aa  70.9  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0858  hypothetical protein  33.75 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1312  hypothetical protein  31.29 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.474029 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3380  protein of unknown function DUF123  39.81 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798744  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.2 
 
 		 357 aa  67  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1232  hypothetical protein  32.59 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0479  protein of unknown function DUF123  33.61 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0776  protein of unknown function DUF123  37.5 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0747  hypothetical protein  31.25 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0646  hypothetical protein  35.29 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.269467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1038  hypothetical protein  31.85 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4343 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1211  hypothetical protein  32.35 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.174889  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0578  protein of unknown function DUF123  28.21 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2572  hypothetical protein  36.52 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0067  hypothetical protein  30.95 
 
 		 145 aa  53.9  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1807  hypothetical protein  29.63 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0265  hypothetical protein  26.72 
 
 		 143 aa  48.9  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0984626  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0815  hypothetical protein  26.5 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1958  hypothetical protein  35.35 
 
 		 115 aa  46.6  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0267  hypothetical protein  26.72 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0194677  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1962  hypothetical protein  31.36 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0871  hypothetical protein  32.38 
 
 		 131 aa  45.4  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1123  hypothetical protein  32.39 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>