20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0395 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0395  hypothetical protein  100 
 
 		 515 aa  1059    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1825  beta-lactamase domain-containing protein  56.8 
 
 		 505 aa  610  1e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1198  beta-lactamase domain-containing protein  52.5 
 
 		 509 aa  546  1e-154  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.0100677 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0936  beta-lactamase domain protein  49.9 
 
 		 506 aa  526  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.26189  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0909  beta-lactamase-like  40.08 
 
 		 502 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.79696  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0773  hypothetical protein  39.94 
 
 		 367 aa  257  3e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000921775  hitchhiker  0.000000000779412 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1189  vesicle-fusing ATPase  39.29 
 
 		 344 aa  233  6e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.405449  normal  0.0544197 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0194  beta-lactamase domain-containing protein  27 
 
 		 528 aa  190  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00079509  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1225  hypothetical protein  26.94 
 
 		 316 aa  108  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.66964 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  24.06 
 
 		 354 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  27.35 
 
 		 329 aa  47.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  23.18 
 
 		 354 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 		 313 aa  47.4  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  23.64 
 
 		 352 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  28.89 
 
 		 348 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  28.89 
 
 		 348 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  28.89 
 
 		 344 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6360  beta-lactamase domain protein  22.18 
 
 		 389 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0683384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  24.53 
 
 		 354 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  25.29 
 
 		 295 aa  43.5  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>