19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0296 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0296  hypothetical protein  100 
 
 		 603 aa  1244    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0433  hypothetical protein  54.24 
 
 		 601 aa  660    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.430655  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1552  glycogen synthase  53.55 
 
 		 594 aa  648    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.575386  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1581  glycogen synthase, glycosyltransferase family 3 protein  22.76 
 
 		 604 aa  99.4  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0619337  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3735  Glycogen (starch) synthase  21.56 
 
 		 604 aa  87  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0468  alpha-glucan phosphorylase  25.24 
 
 		 1421 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.06142  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5697  Glycogen(starch) synthase  22.87 
 
 		 606 aa  70.5  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1285  alpha-glucan phosphorylase  22.11 
 
 		 1413 aa  62  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00590  glycogen (starch) synthase, putative  32.65 
 
 		 733 aa  59.3  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81231  glycogen (starch) synthase  35.48 
 
 		 699 aa  53.1  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.490915  normal  0.0297098 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08010  glycogen synthase (Eurofung)  33.87 
 
 		 711 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53633  normal  0.197205 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0612  glycogen synthase  29.57 
 
 		 489 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1042  glycogen synthase, putative  23.82 
 
 		 548 aa  48.1  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0023004 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  28.1 
 
 		 489 aa  47.8  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0344  glycogen synthase  28.06 
 
 		 482 aa  47.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1221  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.48 
 
 		 482 aa  46.6  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.085382  normal  0.2089 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3442  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 		 337 aa  46.2  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0386  glycogen synthase  27.73 
 
 		 483 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3788  glycosyltransferase  39.62 
 
 		 349 aa  44.7  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>