18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3184 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3184  cobyric acid synthase CobQ  100 
 
 
380 aa  783    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.999187  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0207  cobyric acid synthase CobQ  36.62 
 
 
406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1261  hypothetical protein  35.88 
 
 
389 aa  189  9e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.536599  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2605  hypothetical protein  35.07 
 
 
397 aa  185  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.908285 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3041  hypothetical protein  34.83 
 
 
397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2741  hypothetical protein  34.83 
 
 
397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326468  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0319  hypothetical protein  35.83 
 
 
396 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.452457  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0664  hypothetical protein  27.39 
 
 
381 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.105656  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2871  hypothetical protein  31.53 
 
 
292 aa  105  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4360  hypothetical protein  24.51 
 
 
384 aa  72  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2870  hypothetical protein  34.38 
 
 
90 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2035  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  26.07 
 
 
363 aa  47  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.923739  normal  0.0106214 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5058  beta-lactamase domain protein  25.63 
 
 
396 aa  46.2  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  34.52 
 
 
461 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35 
 
 
761 aa  43.1  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  32.47 
 
 
292 aa  43.1  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  32.47 
 
 
291 aa  43.1  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2755  beta-lactamase domain-containing protein  34.62 
 
 
300 aa  42.7  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>