18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0593 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0593  lipoprotein (VmcD)  100 
 
 
309 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0596  lipoprotein (VmcA)  43.35 
 
 
492 aa  102  6e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.605636  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0595  lipoprotein (VmcB)  44.86 
 
 
235 aa  91.7  1e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.905268  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0629  lipoprotein (VmcE)  30.93 
 
 
215 aa  55.8  0.000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0157235  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0630  lipoprotein (VmcF)  74.07 
 
 
176 aa  53.1  0.000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0251425  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  30.07 
 
 
1367 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0605  putative lipoprotein  79.17 
 
 
132 aa  47.8  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0710239  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0594  lipoprotein (VmcC)  40 
 
 
144 aa  47.4  0.0003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1311  hypothetical protein  27.14 
 
 
697 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00222166  hitchhiker  0.000000478803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1497  chromosome segregation ATPase-like protein  28.22 
 
 
1209 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.440626 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1411  sugar-binding domain protein  35.14 
 
 
2126 aa  46.6  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.183423  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03270  conserved hypothetical protein  34.85 
 
 
1572 aa  46.2  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.630468  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1050  hypothetical protein  25.22 
 
 
1246 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  26.83 
 
 
1068 aa  44.7  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0042  putative lipoprotein  34.57 
 
 
533 aa  44.3  0.003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.444396  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  20.96 
 
 
958 aa  44.3  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0721  putative lipoprotein  42.62 
 
 
414 aa  43.1  0.006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.327009  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0272  putative lipoprotein  38.98 
 
 
172 aa  42.4  0.009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00501644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>