24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2862 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2862  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  763    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0260  hypothetical protein  34.38 
 
 		 403 aa  197  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1659  hypothetical protein  35.54 
 
 		 354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.256819  normal  0.444616 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5947  hypothetical protein  35.51 
 
 		 393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095496 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3083  protein of unknown function DUF201  33.79 
 
 		 380 aa  157  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3534  hypothetical protein  34.68 
 
 		 391 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6003  protein of unknown function DUF201  36.75 
 
 		 376 aa  153  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866607  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2608  hypothetical protein  32.2 
 
 		 386 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0133551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5779  hypothetical protein  35.53 
 
 		 384 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0168364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0529  hypothetical protein  35.44 
 
 		 383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.865986 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6483  hypothetical protein  33.5 
 
 		 407 aa  143  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.422069 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2386  protein of unknown function DUF201  31.98 
 
 		 381 aa  142  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2432  hypothetical protein  32.63 
 
 		 402 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2165  protein of unknown function DUF201  32.89 
 
 		 412 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111476  normal  0.292956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1830  hypothetical protein  31.55 
 
 		 374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3151  hypothetical protein  28.75 
 
 		 415 aa  125  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1781  protein of unknown function DUF201  32.18 
 
 		 378 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1666  hypothetical protein  24.52 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2022  protein of unknown function DUF201  22.33 
 
 		 425 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2798  hypothetical protein  25.17 
 
 		 366 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0197  hypothetical protein  24.92 
 
 		 391 aa  46.6  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2010  protein of unknown function DUF201  25.48 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  0.206685 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1541  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  40.38 
 
 		 1077 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2914  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.71 
 
 		 1070 aa  44.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>