45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1833 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1833  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  738    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1935  protein of unknown function DUF1611  51.35 
 
 		 354 aa  335  5.999999999999999e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.614904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1538  hypothetical protein  40.82 
 
 		 353 aa  256  4e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2299  hypothetical protein  41.74 
 
 		 392 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0130  hypothetical protein  34.19 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.550989  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0132  hypothetical protein  34.19 
 
 		 338 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0205  protein of unknown function DUF1611  30.21 
 
 		 337 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1378  protein of unknown function DUF1611  32.46 
 
 		 337 aa  126  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2779  hypothetical protein  35.4 
 
 		 348 aa  123  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3511  hypothetical protein  33.22 
 
 		 348 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2372  hypothetical protein  31.41 
 
 		 349 aa  120  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1623  protein of unknown function DUF1611  33.01 
 
 		 363 aa  119  7.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.631955 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4403  protein of unknown function DUF1611  30.95 
 
 		 343 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.654147  hitchhiker  0.000982381 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0852  hypothetical protein  32.21 
 
 		 360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.98076  normal  0.809264 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4341  protein of unknown function DUF1611  30.66 
 
 		 343 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1405  hypothetical protein  28.82 
 
 		 348 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0792  hypothetical protein  30.68 
 
 		 365 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4542  hypothetical protein  33.78 
 
 		 340 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3257  hypothetical protein  27.52 
 
 		 359 aa  100  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.161607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3589  protein of unknown function DUF1611  29.03 
 
 		 348 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0838311 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1462  hypothetical protein  34.06 
 
 		 346 aa  99.4  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0204992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2290  protein of unknown function DUF1611  31.04 
 
 		 341 aa  95.1  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1206  protein of unknown function DUF1611  29.69 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.356367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4476  protein of unknown function DUF1611  29.75 
 
 		 340 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0593  protein of unknown function DUF1611  28.12 
 
 		 340 aa  92.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2789  hypothetical protein  27.95 
 
 		 333 aa  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3166  hypothetical protein  27.7 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1127  hypothetical protein  30.9 
 
 		 340 aa  92  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160448 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0366  hypothetical protein  27.39 
 
 		 333 aa  91.7  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4657  hypothetical protein  29.66 
 
 		 337 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3968  protein of unknown function DUF1611  29.14 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0847793  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0034  hypothetical protein  26.74 
 
 		 332 aa  89.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1220  protein of unknown function DUF1611  28.1 
 
 		 330 aa  87  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2786  protein of unknown function DUF1611  28.72 
 
 		 329 aa  86.7  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000678  EBNA-1 nuclear protein  28.62 
 
 		 334 aa  87  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06557  hypothetical protein  27.52 
 
 		 340 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2482  hypothetical protein  25.7 
 
 		 333 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2903  protein of unknown function DUF1611  32.2 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0416  hypothetical protein  28.87 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1770  hypothetical protein  28.87 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2676  hypothetical protein  31.78 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal  0.475395 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0149  protein of unknown function DUF1611  28.42 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1819  hypothetical protein  28.94 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2798  protein of unknown function DUF1611  29.02 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2557  hypothetical protein  28.36 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>