46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0834 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0834    100 
 
 		 1511 bp  2995    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2017  N-6 DNA methylase  91.12 
 
 		 1554 bp  870    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3128  N-6 DNA methylase  85.83 
 
 		 1557 bp  543  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.465456  decreased coverage  0.00982418 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3006  N-6 DNA methylase  84.64 
 
 		 1563 bp  504  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.809429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2743  type I restriction system adenine methylase  84.12 
 
 		 1557 bp  480  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2286    81.57 
 
 		 1575 bp  337  6e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.204488  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  81.61 
 
 		 1617 bp  174  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3300  N-6 DNA methylase  82.01 
 
 		 1614 bp  147  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000500405 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2509  site-specific DNA-methyltransferase  85.81 
 
 		 1623 bp  117  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.642426 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0272    84 
 
 		 360 bp  89.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176503  unclonable  0.00000792317 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1858  N-6 DNA methylase  88.1 
 
 		 1623 bp  87.7  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3767  N-6 DNA methylase  81.7 
 
 		 1695 bp  81.8  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0005  type I restriction-modification system, M subunit  88.89 
 
 		 1587 bp  79.8  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  82.69 
 
 		 1635 bp  79.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4777  N-6 DNA methylase  89.71 
 
 		 1554 bp  79.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1102  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  80.46 
 
 		 1647 bp  75.8  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.358797  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1086  type I restriction-modification system, M subunit  92.45 
 
 		 1731 bp  73.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2793  type I restriction-modification system, M subunit  87.5 
 
 		 1578 bp  71.9  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1940  N-6 DNA methylase  88.24 
 
 		 1608 bp  71.9  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0625168  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2418  N-6 DNA methylase  87.5 
 
 		 1578 bp  71.9  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.572428  normal  0.0719197 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1385    89.83 
 
 		 1583 bp  69.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3915  N-6 DNA methylase  80.5 
 
 		 1626 bp  69.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  93.33 
 
 		 1560 bp  65.9  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3080  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  93.33 
 
 		 1650 bp  65.9  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1096  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 1632 bp  63.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  88.33 
 
 		 1512 bp  63.9  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  91.67 
 
 		 1635 bp  63.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  86.76 
 
 		 1599 bp  63.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1809  hypothetical protein  97.22 
 
 		 2550 bp  63.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4931  type I restriction-modification system, M subunit  84.42 
 
 		 1620 bp  58  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal  0.593383 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0004  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  100 
 
 		 1554 bp  56  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 1536 bp  56  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  94.44 
 
 		 1950 bp  56  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2908  N-6 DNA methylase  92.31 
 
 		 1572 bp  54  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3008  hypothetical protein  92.31 
 
 		 3039 bp  54  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0711  hypothetical protein  92.31 
 
 		 537 bp  54  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.6972599999999998e-31 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  100 
 
 		 1494 bp  52  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0836  type I restriction-modification system S subunit  96.67 
 
 		 1251 bp  52  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  88 
 
 		 1560 bp  52  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  83.12 
 
 		 2583 bp  50.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1359  N-6 DNA methylase  91.89 
 
 		 1590 bp  50.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0032  N-6 DNA methylase  93.94 
 
 		 1635 bp  50.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  93.94 
 
 		 2451 bp  50.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2248  N-6 DNA methylase  93.75 
 
 		 1566 bp  48.1  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0522014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2236  N-6 DNA methylase  93.75 
 
 		 1587 bp  48.1  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2033  N-6 DNA methylase  96.43 
 
 		 2328 bp  48.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599209  normal  0.628554 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>