26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0218 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0218  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4464  hypothetical protein  59.59 
 
 		 301 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5102  hypothetical protein  57.44 
 
 		 300 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3634  hypothetical protein  57.99 
 
 		 298 aa  323  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.651721 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0968  hypothetical protein  57.09 
 
 		 298 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0409  hypothetical protein  56.93 
 
 		 284 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.991789  normal  0.340922 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1457  hypothetical protein  57.3 
 
 		 280 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609075 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1586  hypothetical protein  57.93 
 
 		 281 aa  303  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1543  hypothetical protein  54.98 
 
 		 275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1259  hypothetical protein  54.98 
 
 		 275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.495677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1072  hypothetical protein  56.9 
 
 		 300 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1416  hypothetical protein  51.11 
 
 		 280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5905  hypothetical protein  49.03 
 
 		 288 aa  254  8e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0110  hypothetical protein  49.23 
 
 		 290 aa  240  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0999  hypothetical protein  50 
 
 		 285 aa  239  5e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0735547  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1571  hypothetical protein  48.51 
 
 		 275 aa  236  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3597  hypothetical protein  48.03 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2193  hypothetical protein  49.81 
 
 		 276 aa  214  9e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0542  hypothetical protein  50.38 
 
 		 276 aa  208  8e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218634  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1245  hypothetical protein  48.32 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.806576 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01370  hypothetical protein  28.04 
 
 		 287 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1418  hypothetical protein  26.6 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.318013 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0276  hypothetical protein  29.09 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  25.5 
 
 		 514 aa  59.3  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0566  hypothetical protein  24.91 
 
 		 552 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0583  hypothetical protein  23.69 
 
 		 552 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>