16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01305 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01305  WalW protein  100 
 
 		 333 aa  698    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1196  hypothetical protein  48.12 
 
 		 335 aa  328  9e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1349  hypothetical protein  29.82 
 
 		 336 aa  136  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646155  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1286  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4831  WalW protein  27.97 
 
 		 318 aa  112  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.608303  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 770 aa  106  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2250  hypothetical protein  27.69 
 
 		 311 aa  106  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.741825 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3309  hypothetical protein  31.28 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1802  hypothetical protein  23.22 
 
 		 346 aa  95.5  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3081  hypothetical protein  26.3 
 
 		 336 aa  95.1  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6503  WalW protein  30.57 
 
 		 334 aa  92.8  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2057  hypothetical protein  27.43 
 
 		 341 aa  92.8  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100881  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1397  hypothetical protein  25.68 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.237722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1330  polysaccharide deacetylase  23.55 
 
 		 317 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1349  polysaccharide deacetylase  23.55 
 
 		 317 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.723796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1313  polysaccharide deacetylase  24.24 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>