29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00247 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00247  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshI (pilus type IV)  100 
 
 		 304 aa  625  1e-178  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0540  biogenesis protein MshI  33.59 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0166  hypothetical protein  30.96 
 
 		 310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0462  biogenesis protein MshI  32.03 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.572153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3667  biogenesis protein MshI  32.03 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3490  biogenesis protein MshI  32.03 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4114.2  biogenesis protein MshI  31.13 
 
 		 292 aa  114  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0501  biogenesis protein MshI  30 
 
 		 292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3839  biogenesis protein MshI  30 
 
 		 292 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0480  biogenesis protein MshI  29.6 
 
 		 292 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0450  biogenesis protein MshI  32.28 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0504  biogenesis protein MshI  30 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0556  biogenesis protein MshI  33.52 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4421  biogenesis protein MshI  30.65 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0385  biogenesis protein MshI  34.02 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3772  biogenesis protein MshI  32.65 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3755  biogenesis protein MshI  31.5 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3351  biogenesis protein MshI  28.57 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0749  hypothetical protein  26.87 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.127849  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0466  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHI)  25.68 
 
 		 487 aa  68.9  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0327432  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2817  MSHA biogenesis protein MshI  26.67 
 
 		 479 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0889  hypothetical protein  27.11 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1131  hypothetical protein  23.11 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002365  MSHA biogenesis protein MshI  26.55 
 
 		 481 aa  62  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03701  hypothetical protein  25.4 
 
 		 482 aa  57.4  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0760  hypothetical protein  25.7 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0373973  normal  0.392235 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0381  MshA biogenesis protein MshI-1  23.29 
 
 		 318 aa  53.5  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3278  hypothetical protein  22 
 
 		 330 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3092  hypothetical protein  25.13 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>