21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6914 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6914    100 
 
 		 321 bp  636    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2793    93.33 
 
 		 444 bp  458  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4165    91.21 
 
 		 841 bp  343  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1107  transposase IS4 family protein  87.07 
 
 		 456 bp  303  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4159  transposase IS4 family protein  87.07 
 
 		 456 bp  303  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6136  transposase IS4 family protein  87.07 
 
 		 456 bp  303  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0379    85.05 
 
 		 780 bp  224  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0246    85.95 
 
 		 261 bp  210  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4227    84 
 
 		 793 bp  196  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0923396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4229    84 
 
 		 793 bp  196  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.344496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0539    90.32 
 
 		 144 bp  151  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6645    87.69 
 
 		 144 bp  65.9  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3940    87.69 
 
 		 228 bp  65.9  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114444  hitchhiker  0.00715873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0481  putative transposase  87.93 
 
 		 288 bp  60  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988677  normal  0.294669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2910    87.04 
 
 		 869 bp  52  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216552  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2794  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 1017 bp  50.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0280  30S ribosomal protein S7P  100 
 
 		 615 bp  46.1  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531447  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3085    91.43 
 
 		 429 bp  46.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  100 
 
 		 755 bp  46.1  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  100 
 
 		 755 bp  46.1  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6121  putative transposase  100 
 
 		 261 bp  46.1  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>