25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5779 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5779  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  719    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0168364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6003  protein of unknown function DUF201  76.27 
 
 		 376 aa  480  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866607  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2165  protein of unknown function DUF201  54.11 
 
 		 412 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111476  normal  0.292956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0529  hypothetical protein  59.35 
 
 		 383 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.865986 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1830  hypothetical protein  52.19 
 
 		 374 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1781  protein of unknown function DUF201  51.29 
 
 		 378 aa  300  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2386  protein of unknown function DUF201  43.41 
 
 		 381 aa  205  9e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3534  hypothetical protein  43.83 
 
 		 391 aa  203  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0260  hypothetical protein  33.86 
 
 		 403 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1659  hypothetical protein  38.94 
 
 		 354 aa  169  9e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.256819  normal  0.444616 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2862  hypothetical protein  35.65 
 
 		 380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5947  hypothetical protein  34.26 
 
 		 393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095496 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2608  hypothetical protein  37.5 
 
 		 386 aa  149  9e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0133551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3083  protein of unknown function DUF201  35.24 
 
 		 380 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2432  hypothetical protein  33.5 
 
 		 402 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6483  hypothetical protein  33.52 
 
 		 407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.422069 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3151  hypothetical protein  34.32 
 
 		 415 aa  109  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1666  hypothetical protein  27.64 
 
 		 355 aa  88.6  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2022  protein of unknown function DUF201  24.82 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1523  hypothetical protein  29.35 
 
 		 357 aa  50.8  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2798  hypothetical protein  30 
 
 		 366 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1032  hypothetical protein  17.72 
 
 		 353 aa  46.2  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1278  hypothetical protein  23.84 
 
 		 357 aa  43.5  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.422818  normal  0.140099 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0268  ornithine carbamoyltransferase  26.59 
 
 		 301 aa  43.5  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.313188 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2010  protein of unknown function DUF201  26.98 
 
 		 360 aa  43.5  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  0.206685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>