16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0162 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0162    100 
 
 
557 bp  1104    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8497    89.74 
 
 
555 bp  539  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6341    89.52 
 
 
367 bp  274  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5626  transposase  83.89 
 
 
1254 bp  254  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35278 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0831    86.21 
 
 
258 bp  155  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.280807  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2712    84.96 
 
 
239 bp  81.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09510    80.26 
 
 
1188 bp  63.9  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6861  transposase  78.76 
 
 
1209 bp  58  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36140  FOG transposase  83.95 
 
 
1206 bp  58  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0467  transposase IS701  90 
 
 
1251 bp  48.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.529272  normal  0.0154733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1257    90 
 
 
2455 bp  48.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697608  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1727  transposase IS701  90 
 
 
1251 bp  48.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1737    90 
 
 
2420 bp  48.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.460985  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1738  transposase IS701  90 
 
 
1251 bp  48.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2323  transposase IS701  90 
 
 
1251 bp  48.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.564706  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2731  transposase IS701  90 
 
 
1251 bp  48.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.105734 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>