16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1342 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1342  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  231  3e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0347  transposase  62.04 
 
 		 330 aa  135  1e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.571116  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  31.82 
 
 		 278 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  31.82 
 
 		 278 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02200  YadA protein  30.77 
 
 		 279 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04289  transposase  30.77 
 
 		 279 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02160  hypothetical protein  30.77 
 
 		 279 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.604012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02377  hypothetical protein  30.77 
 
 		 279 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1128  IS3 family transposase OrfB  34.38 
 
 		 267 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0056  IS3 family transposase OrfB  34.38 
 
 		 267 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3342  transposase for IS150  28.45 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3593  hypothetical protein  28.45 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158834 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0806  putative transposase IS3/IS911  32.63 
 
 		 548 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1529  integrase catalytic subunit  32.5 
 
 		 505 aa  41.2  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.544255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1532  integrase catalytic subunit  32.5 
 
 		 505 aa  41.2  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04830  transposase  27.78 
 
 		 283 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0367242  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>