44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_R0050 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_R0050  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190764 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0034  tRNA-Arg  98.41 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00539974  normal  0.850785 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0040  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0022  tRNA-Arg  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0042  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0050  tRNA-Arg  91.55 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.130666  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0045  tRNA-Arg  91.55 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.350958 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0476936  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0063  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0069  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0069  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0017  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.034948 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0137  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1133  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.168397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1126  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1010  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2639  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.993285  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0067  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0069  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14016  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0042  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1291  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0929  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0164409  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0021  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.223041  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0077  tRNA-Arg  89.71 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0009  tRNA-Arg  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162102  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS04383  tRNA-Arg  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0006  tRNA-Arg  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0058  tRNA-Arg  87.14 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0009  tRNA-Arg  88.71 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0023  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0009  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0043  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.142903  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0030  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0024  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.278422  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0012  tRNA-Arg  87.1 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0050  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385714  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0011  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165589  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0049  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0055  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0048  tRNA-Arg  84.13 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0481693  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0045  tRNA-Arg  84.13 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0041  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000926852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0017  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0038  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000303036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>