10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_R0055 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_R0055  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04383  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0006  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0009  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0040  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0042  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0021  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.223041  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0024  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.278422  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0050  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190764 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0030  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>