10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3190 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3190  hypothetical protein  100 
 
 		 661 aa  1308    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000624567 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4017  hypothetical protein  34.36 
 
 		 605 aa  286  5.999999999999999e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4398  hypothetical protein  33.83 
 
 		 608 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6300  calcineurin-like phosphoesterase family protein  32.5 
 
 		 549 aa  257  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3941  hypothetical protein  30.75 
 
 		 579 aa  249  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2179  hypothetical protein  29.3 
 
 		 590 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.92082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2336  hypothetical protein  29.3 
 
 		 590 aa  224  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1802  hypothetical protein  26.55 
 
 		 828 aa  107  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.326364  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6679  hypothetical protein  24.84 
 
 		 502 aa  70.5  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207997  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1801  metallophosphoesterase  24.51 
 
 		 517 aa  65.1  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.050773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>