20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3142 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3142  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  397  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3074  protein of unknown function DUF447  65.59 
 
 		 193 aa  249  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2617  hypothetical protein  64.77 
 
 		 196 aa  245  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0409017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6498  hypothetical protein  58.85 
 
 		 201 aa  222  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760399  normal  0.0435386 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2455  hypothetical protein  58.12 
 
 		 199 aa  221  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.11758  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5940  hypothetical protein  56.18 
 
 		 197 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1580  hypothetical protein  51.31 
 
 		 191 aa  194  9e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000289305  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4099  hypothetical protein  54.01 
 
 		 189 aa  191  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1841  hypothetical protein  49.16 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1792  hypothetical protein  48.6 
 
 		 198 aa  175  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2176  protein of unknown function DUF447  48.6 
 
 		 198 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.504113 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1244  hypothetical protein  55.41 
 
 		 176 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2393  protein of unknown function DUF447  50.27 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2726  hypothetical protein  47.49 
 
 		 196 aa  167  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5322  protein of unknown function DUF447  44.94 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193969  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5018  hypothetical protein  46.07 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2424  protein of unknown function DUF447  28.36 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0904426  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0630  hypothetical protein  23.43 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1332  hypothetical protein  23.81 
 
 		 187 aa  45.1  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.424525  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1353  hypothetical protein  23.3 
 
 		 181 aa  45.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>