13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1980 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1980  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  259  6.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00382946 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3522  hypothetical protein  69.29 
 
 		 152 aa  187  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02499  hypothetical protein  31.53 
 
 		 121 aa  52.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4231  cupin 2, barrel  29.2 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0456  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.69 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1547  hypothetical protein  25.21 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683626  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1344  hypothetical protein  36.36 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0765  hypothetical protein  33.77 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.618728  normal  0.762349 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03688  hypothetical protein  34.52 
 
 		 172 aa  43.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3129  hypothetical protein  26.77 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5028  hypothetical protein  36.71 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0640594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4863  hypothetical protein  26.05 
 
 		 132 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.368974  normal  0.880715 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1385  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.41 
 
 		 146 aa  40  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000336735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>