34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1020 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1020  flagellar export protein FliJ  100 
 
 		 159 aa  321  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0569  flagellar biosynthesis chaperone  53.02 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3803  flagellar export protein FliJ  36.5 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00367216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3077  flagellar export protein FliJ  36.5 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138763  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0642  flagellar export protein FliJ  37.14 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4391  flagellar export protein FliJ  35.25 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0554  flagellar export FliJ  32.86 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1540  flagellar biosynthesis chaperone  29.93 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3690  flagellar biosynthesis chaperone  29.11 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4365  flagellar biosynthesis chaperone  29.93 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.573361 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2821  flagellar biosynthesis chaperone  28.57 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0229803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1502  flagellar biosynthesis chaperone  29.2 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.871829  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3926  flagellar biosynthesis chaperone  28.47 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.706658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0162  flagellar FliJ protein  30.37 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2010  flagellar biosynthesis chaperone  28.47 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2294  flagellar biosynthesis chaperone  28.47 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2395  flagellar biosynthesis chaperone  28.47 
 
 		 148 aa  47.8  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.437511  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1117  flagellar export protein FliJ  34.59 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1959  flagellar export FliJ  28.28 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.128196  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3774  flagellar export protein FliJ  28.89 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.871006 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2951  flagellar biosynthesis chaperone  27.01 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2935  flagellar export protein FliJ  27.41 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4266  flagellar biosynthesis chaperone  33.66 
 
 		 147 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.314958  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50080  flagellar biosynthesis chaperone  33.66 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0139652 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0769  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  30.82 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.635928  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1706  flagellar export protein FliJ  30.56 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1965  flagellar export protein FliJ  30.43 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.273851  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2175  flagellar biosynthesis chaperone  30.56 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0416512  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2042  flagellar biosynthesis chaperone  30.56 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.754979  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1700  flagellar biosynthesis chaperone  30.56 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558813 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1242  flagellar biosynthesis chaperone  30.56 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2718  flagellar biosynthesis chaperone  30.56 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.482676  normal  0.686371 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2904  flagellar export protein FliJ  29.2 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1974  flagellar export FliJ  29.03 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>