90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_t1597 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_t1597  tRNA-Asp  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287009  normal  0.565179 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1606  tRNA-Asp  97.26 
 
 		 73 bp  129  9.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.847365 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1571  tRNA-Asp  97.26 
 
 		 73 bp  129  9.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0045  tRNA-Asp  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000116789  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt018  tRNA-Asp  97.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00304559  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0747  tRNA-Asp  97.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0110  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000668048  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5679  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0148984  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5668  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000870426  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5652  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000163084  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5021  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00200372  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0866  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000767893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0605  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000119213  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0307  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0295  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000294732  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0150  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000141684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0130  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243711  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5711  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000863381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0083  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000718612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0058  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000630751  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0047  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000234658  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0146  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000101339  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0126  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00683809  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0106  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00926761  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0273  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0074  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0057  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0043  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0112  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00279074  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0057  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5574  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9393e-28 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4990  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0791  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.86781e-33 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0530  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.95974e-30 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0283  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5660  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000269151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5344  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000194135  hitchhiker  0.00000000000721362 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5048  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5036  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.792887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4772  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000243469  hitchhiker  6.32528e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4565  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000215679  normal  0.0856586 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0225  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000284447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5831  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0076889  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5806  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5738  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000152402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asp-3  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015926  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asp-5  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00238664  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asp-4  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.5989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asp-3  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000136459  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asp-6  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000555037  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asp-5  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0178189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asp-4  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0058  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000294938  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00173091  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5735  tRNA-Asx  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0508146  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5719  tRNA-Asx  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165696  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5700  tRNA-Asx  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000330168  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5676  tRNA-Asx  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000169652  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5670  tRNA-Asx  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5668  tRNA-Asx  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.677491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asp-6  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0108566  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asp-5  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002445  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0046  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000245211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0079  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000702096  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asp-6  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124781  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asp-4  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000798458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asp-3  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000451137  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000558705  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asp-6  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000639315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asp-5  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000325882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asp-4  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asp-3  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0355415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000621427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0077  tRNA-Asp  89.58 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148053  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0016  tRNA-Asp  90.7 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.330685  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1217  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.795729  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0102233  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Asp-3  tRNA-Asp  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0047  tRNA-Asp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000554714  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0032  tRNA-Asp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.03601e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0012  tRNA-Asp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618539  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0033  tRNA-Glu  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000114551  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.068843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_895  tRNA-Glu  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000162495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>