34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0136 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0136  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  455  1e-127  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0732  metal-dependent membrane protease  33.91 
 
 
232 aa  94.4  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00162011  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2561  metal-dependent membrane protease  32.92 
 
 
234 aa  72.4  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4829  abortive infection protein  30.07 
 
 
237 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0145  caax amino protease family protein  24.61 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353026 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5028  CAAX amino terminal protease family protein  30.53 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000029132  normal  0.883864 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  36.56 
 
 
249 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  36.56 
 
 
249 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  36.56 
 
 
249 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  36.56 
 
 
235 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  36.56 
 
 
249 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  36.56 
 
 
249 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0250  abortive infection protein  35.48 
 
 
250 aa  46.2  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00998587  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  36.56 
 
 
253 aa  46.2  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0296  CAAX amino terminal protease family protein  34.65 
 
 
249 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00879326  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0017  CAAX amino terminal protease family protein  26.67 
 
 
227 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000644496  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1283  abortive infection protein  30.5 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237963  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2510  abortive infection protein  30.12 
 
 
282 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00961161  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0244  abortive infection protein  35.48 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000696395  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1867  abortive infection protein  28.26 
 
 
211 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  23.86 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1832  abortive infection protein  28.26 
 
 
211 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
237 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  23.86 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  23.86 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  23.86 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0174  caax amino protease family protein  24.87 
 
 
227 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000028794  hitchhiker  4.68107e-34 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  32.05 
 
 
237 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5928  Abortive infection protein  29.35 
 
 
238 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5144  CAAX amino terminal protease family protein  28.67 
 
 
237 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3454  CAAX amino terminal protease family protein  31.25 
 
 
217 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0370625  hitchhiker  5.35761e-17 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3071  Abortive infection protein  34.62 
 
 
251 aa  42  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10671  integral membrane protein  30.38 
 
 
238 aa  41.6  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>