73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_07580 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_07580  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  147  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.87858  normal  0.455948 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3643  RNA-binding S4 domain-containing protein  55.36 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.252029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22660  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.294703  normal  0.222073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2770  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.36 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.013443  normal  0.790943 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0112  RNA-binding S4 domain protein  50 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.361623  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3116  RNA-binding S4 domain-containing protein  50.91 
 
 		 72 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3156  RNA-binding S4 domain-containing protein  50.91 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.914223  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3096  RNA-binding S4  50.91 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06080  hypothetical protein  50.82 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0126  RNA-binding S4 domain protein  50.85 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.564525  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0041  RNA-binding S4 domain protein  43.86 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0003  hypothetical protein  39.66 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000654454  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0003  S4-like RNA binding protein  36.92 
 
 		 73 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000208957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5317  hypothetical protein  39.66 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0232645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0003  S4 region YaaA family protein  39.66 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0003  hypothetical protein  39.66 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0881433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0003  hypothetical protein  38.81 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.239482  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0003  RNA-binding S4  58.33 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000218407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0003  hypothetical protein  38.81 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0003  hypothetical protein  38.81 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0003  hypothetical protein  37.93 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0003  hypothetical protein  37.93 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1729  RNA-binding S4 domain protein  45.45 
 
 		 91 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180543  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0003  hypothetical protein  37.93 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.674518  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0003  hypothetical protein  37.93 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000693166  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6817  hypothetical protein  44.83 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1607  RNA-binding S4 domain protein  48.08 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.932623 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1301  RNA-binding S4 domain protein  47.62 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517293  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1550  S4 domain protein YaaA  43.64 
 
 		 71 aa  50.4  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.715034  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3548  RNA-binding S4 domain protein  50 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1693  RNA-binding S4 domain-containing protein  54.55 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0200012  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1365  RNA-binding S4 domain protein  45.31 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000548467 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1328  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.45 
 
 		 92 aa  48.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0832  hypothetical protein  40.35 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.17612  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0003  S4-like RNA binding protein  42.11 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2642  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.06 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0497559  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00030  RNA-binding S4 domain protein  45.45 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0003  S4 domain-containing protein  46 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0003  S4 domain-containing protein  46 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3479  RNA-binding S4  44.26 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0173  S4 domain protein YaaA  41.82 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0003  S4 domain protein YaaA  37.84 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2468  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.62 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000314319 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0618  RNA-binding S4 domain-containing protein  40 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2373  RNA-binding S4  41.07 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2293  RNA-binding S4 domain protein  42.11 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.26047 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2197  hypothetical protein  46 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.330181 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1088  RNA-binding S4 domain protein  37.5 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3069  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.5 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000897832  hitchhiker  0.000868663 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0789  hypothetical protein  39.66 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2397  RNA-binding S4 domain protein  36.99 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0714362  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0002  RNA-binding S4 domain protein  37.31 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000678168  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  47.92 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0414  RNA-binding S4 domain protein  40 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1264  RNA-binding S4  35.94 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0001495 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0003  RNA-binding S4 domain protein  43.64 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.241542  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0098  RNA-binding S4  42.19 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000456096  normal  0.262898 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5767  hypothetical protein  43.64 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0003  S4 domain protein YaaA  40 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000126771  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09031  hypothetical protein  36.21 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0342  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.82 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000486446  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1224  hypothetical protein  44 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0985687 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0003  S4 region, YaaA  33.85 
 
 		 73 aa  41.2  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0735  hypothetical protein  37.93 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142682  normal  0.673905 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0046  hypothetical protein  38.6 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0805  hypothetical protein  37.93 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1581  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.06 
 
 		 77 aa  40.4  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0305147  normal  0.476483 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  33.33 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2003  RNA-binding S4 domain protein  36.62 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0003  S4 domain protein YaaA  38.6 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0313437  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0676  RNA-binding S4  34.85 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04773  hypothetical protein  36 
 
 		 80 aa  40  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6671  hypothetical protein  37.5 
 
 		 73 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.0976686 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>