9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4004 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4004  hypothetical protein  100 
 
 		 551 aa  1032    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4620  hypothetical protein  29.37 
 
 		 515 aa  98.2  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.456962  hitchhiker  0.00062706 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2990  hypothetical protein  33.02 
 
 		 476 aa  63.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  26.98 
 
 		 1489 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  27.81 
 
 		 1528 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  29.15 
 
 		 1528 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  28.92 
 
 		 1518 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  28.88 
 
 		 1508 aa  54.7  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  28.49 
 
 		 1495 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>