17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2313 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2313  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  215  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0962  hypothetical protein  55.17 
 
 
273 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3391  hypothetical protein  64.18 
 
 
445 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1945  hypothetical protein  51.81 
 
 
266 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3385  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  61.29 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1858  hypothetical protein  48.68 
 
 
211 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000275455  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2274  hypothetical protein  63.79 
 
 
122 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.129304  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2936  hypothetical protein  62.22 
 
 
448 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000867442  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0290  hypothetical protein  46.67 
 
 
266 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2819  hypothetical protein  62.79 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00145437  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44705  predicted protein  37.1 
 
 
735 aa  48.5  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1425  UvrD/REP helicase  38.64 
 
 
833 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0769  hypothetical protein  58.82 
 
 
378 aa  43.5  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.994744  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0215  Beta-ketoacyl synthase  70 
 
 
1759 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2996  hypothetical protein  30.16 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1771  hypothetical protein  29.35 
 
 
307 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0430779  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4787  collagen triple helix repeat-containing protein  58.33 
 
 
111 aa  40.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>