12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1355 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1355  ribokinase family sugar kinase  100 
 
 
224 aa  460  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1009  PfkB domain protein  40.41 
 
 
283 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1951  PfkB  29.81 
 
 
318 aa  91.3  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194411  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4175  ribokinase-like domain-containing protein  26.73 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2113  PfkB domain protein  29.57 
 
 
304 aa  68.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3352  ribokinase family sugar kinase  27.23 
 
 
303 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.38232  decreased coverage  0.00309735 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3511  PfkB domain protein  23.94 
 
 
306 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.280812  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1114  PfkB domain protein  26.85 
 
 
325 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4369  PfkB domain-containing protein  24.39 
 
 
307 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0977  rfaE bifunctional protein  30.19 
 
 
491 aa  42.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.673114  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09710  PfkB domain protein  22.16 
 
 
305 aa  42.7  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2117  PfkB domain protein  30.38 
 
 
338 aa  42.4  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.496872  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>