11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2036 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2036  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  353  1e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.316596  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2936  hypothetical protein  42.18 
 
 		 182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0871  hypothetical protein  38.75 
 
 		 184 aa  107  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0544539  normal  0.144695 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4204  hypothetical protein  40.97 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2903  hypothetical protein  38.13 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.700783  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2942  hypothetical protein  34.48 
 
 		 174 aa  84.3  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000148294  decreased coverage  0.00000918436 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0964  hypothetical protein  29.41 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3518  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.1 
 
 		 211 aa  50.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174485 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3372  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  26.22 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.779768 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3769  hypothetical protein  27.92 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3674  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  24.12 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.396791 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>