36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1631 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1631  hypothetical protein  100 
 
 
483 aa  981    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576046  normal  0.91477 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2902  hypothetical protein  64.55 
 
 
463 aa  601  1.0000000000000001e-171  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176162  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2178  hypothetical protein  62.5 
 
 
452 aa  552  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1074  hypothetical protein  65.7 
 
 
414 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541704  normal  0.984253 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2467  putative large terminase  65.94 
 
 
414 aa  544  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1129  hypothetical protein  65.94 
 
 
414 aa  544  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1057  hypothetical protein  62.12 
 
 
425 aa  519  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0533808 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3472  hypothetical protein  52.64 
 
 
431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3704  hypothetical protein  50.8 
 
 
446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1160  hypothetical protein  49.53 
 
 
422 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375561  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3147  hypothetical protein  53.96 
 
 
416 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.284595  normal  0.0189351 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1408  hypothetical protein  49.07 
 
 
422 aa  390  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2102  protein of unknown function DUF264  53.87 
 
 
386 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000296249  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1800  hypothetical protein  49.07 
 
 
423 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.983484  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3490  hypothetical protein  49.04 
 
 
423 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1330  large terminase  50.83 
 
 
459 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1964  hypothetical protein  51.44 
 
 
386 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.817651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1708  protein of unknown function DUF264  50.25 
 
 
421 aa  372  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.644471  normal  0.0322658 
 
 
-
 
NC_004310  BR0585  terminase large subunit, putative  53.17 
 
 
384 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1434  hypothetical protein  48.13 
 
 
458 aa  368  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0586  putative terminase large subunit  52.91 
 
 
380 aa  362  8e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4961  hypothetical protein  49.31 
 
 
432 aa  360  4e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000421894 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0902  hypothetical protein  51.76 
 
 
448 aa  359  5e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.225304 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1976  hypothetical protein  51.46 
 
 
370 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.493623  normal  0.545091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1430  protein of unknown function DUF264  50.73 
 
 
421 aa  354  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.396368 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3118  hypothetical protein  46.77 
 
 
440 aa  335  7.999999999999999e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3918  hypothetical protein  50 
 
 
439 aa  331  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0145321 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2004  hypothetical protein  46.3 
 
 
436 aa  327  3e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0120622 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0918  hypothetical protein  47.04 
 
 
450 aa  325  1e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1896  hypothetical protein  49.43 
 
 
443 aa  156  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3628  hypothetical protein  39.29 
 
 
690 aa  149  9e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3483  hypothetical protein  30.3 
 
 
453 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3043  protein of unknown function DUF264  41.28 
 
 
435 aa  146  9e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2716  Phage uncharacterized protein-like  39.09 
 
 
458 aa  141  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0633  hypothetical protein  40.1 
 
 
509 aa  124  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0384  hypothetical protein  44.44 
 
 
426 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.22896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>