9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_R0003 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_R0003  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.220324  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0033  tRNA-Thr  96 
 
 		 74 bp  117  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0052  tRNA-Thr  94.67 
 
 		 74 bp  109  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0016  tRNA-Thr  94.67 
 
 		 74 bp  109  9.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232936  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0017  tRNA-Thr  88 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0721546  normal  0.333053 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0024  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000131276  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0034  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0042  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03580  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.731888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>