18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2479 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2479  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  358  3e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2931  hypothetical protein  42.71 
 
 		 157 aa  104  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0484753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1367  hypothetical protein  56 
 
 		 272 aa  78.6  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0458  hypothetical protein  59.26 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.78691 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1732  PASTA domain containing protein  48.08 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.186477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0991  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  30.89 
 
 		 464 aa  56.2  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2791  hypothetical protein  49.5 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2455  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  38.36 
 
 		 530 aa  53.9  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4995  hypothetical protein  39.85 
 
 		 893 aa  53.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.124549  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1577  hypothetical protein  34.15 
 
 		 335 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2163  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  51.02 
 
 		 464 aa  47.8  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.734471  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3696  DNA-directed DNA polymerase  44.23 
 
 		 422 aa  45.4  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0931583  normal  0.897611 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2067  DNA-directed DNA polymerase  41.82 
 
 		 388 aa  45.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0860005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3159  DNA-directed DNA polymerase  50 
 
 		 431 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.382923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  40.85 
 
 		 466 aa  43.1  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0274  DNA-directed DNA polymerase  57.89 
 
 		 385 aa  42.4  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1323  DNA-directed DNA polymerase  44.19 
 
 		 416 aa  42  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2649  DNA-directed DNA polymerase  44.9 
 
 		 403 aa  41.6  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>