15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0830 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0830  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  227  4e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2417  hypothetical protein  61.11 
 
 
78 aa  95.1  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0135  hypothetical protein  59.72 
 
 
77 aa  90.9  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.697287  normal  0.0496902 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4237  putative PAS/PAC sensor protein  47.95 
 
 
843 aa  72  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.28007  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3379  putative PAS/PAC sensor protein  49.32 
 
 
449 aa  69.3  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4113  putative PAS/PAC sensor protein  45.76 
 
 
896 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1553  hypothetical protein  43.9 
 
 
117 aa  61.6  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4080  putative PAS/PAC sensor protein  42.25 
 
 
1081 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 
817 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4272  putative PAS/PAC sensor protein  36.9 
 
 
919 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.312579  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3482  putative PAS/PAC sensor protein  42.31 
 
 
994 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4828  hypothetical protein  36.76 
 
 
121 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4288  hypothetical protein  43.4 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0178694  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 
786 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
821 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>