13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_4288 on replicon NC_013925
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013925  Nmag_4288  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  187  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0178694  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0135  hypothetical protein  45.45 
 
 
77 aa  57.4  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.697287  normal  0.0496902 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2417  hypothetical protein  46.97 
 
 
78 aa  57  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0830  hypothetical protein  43.4 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4237  putative PAS/PAC sensor protein  48.94 
 
 
843 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.28007  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4080  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 
1081 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3379  putative PAS/PAC sensor protein  49.06 
 
 
449 aa  47.4  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4113  putative PAS/PAC sensor protein  52.17 
 
 
896 aa  47.4  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3482  putative PAS/PAC sensor protein  47.92 
 
 
994 aa  45.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.83 
 
 
786 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1553  hypothetical protein  32.1 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4828  hypothetical protein  36.36 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4272  putative PAS/PAC sensor protein  44.9 
 
 
919 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.312579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>